Kemi 25 Molecular Modelling ( forår 2008 - 5 ECTS )
Rammer for udbud
-
Uddannelsessprog:
(se under Undervisnings- og arbejdsform)
-
Niveau:
Grundkursus.
-
Semester/kvarter:
Kurset udbydes i 4. kvarter.
-
Timer per uge:
8
-
Deltagerbegrænsning:
-
Undervisningssted:
Århus
-
Hovedområde:
Det Naturvidenskabelige Fakultet
-
Udbud ID:
7679
Formål
Kursets formål er at give de studerende indblik og praktiske erfaringer med nogle af de teknikker, der anvendes i molecular modelling inden for moderne kemi.
Obligatorisk program
Rapporter over øvelserne.
Indhold
Kurset er anvendelsesorienteret. Der arbejdes med en kvantemekanisk beskrivelse af molekyler (Hartree-Fock, semi-empiriske og tæthedsfunktional teori) og med en molekylær mekanisk beskrivelse af molekylerne. Modeller til beskrivelse af solventer behandles. De forskellige kraftfelter (force fields) diskuteres for brug ved småmolekyle henholdsvis makromolekyle modelleringsstudier. Teknikker til energiminimering og konformationsanalyser (molekyle dynamik og Monte Carlo simulering) behandles.
Læringsmål
Når kurset er færdigt, forventes den studerende at
kunne
:
·
gennemføre
en modelberegning af en ukompliceret kemisk problemstilling.
Faglige forudsætninger
Fortrinsvis for studerende på medicinalkemilinien. Kurset forudsætter, at kurset Fysisk kemi er bestået. Det forudsættes, at kurset Molekylspektroskopi og kemisk binding enten er bestået eller følges samtidig.
Kurset er obligatorisk for studerende på medicinalkemilinjen, men er åbent for studerende på andre kemilinjer.
Underviser
Svend Knak Jensen og Birgit Schiøtt.
Undervisnings- og arbejdsform
8 timers forelæsninger/øvelser pr. uge. 2 x 2 timers forelæsninger og 1 x 4 timers øvelser i 4 uger. Derefter 2 x 4 timers øvelser i 3 uger. Øvelserne foregår i IT-laboratoriet med anvendelse af forskellige "molecular modelling" software-programpakker. Øvelserne tilrettelægges i nær tilknytning til den gennemgående teori. Der afleveres rapporter over øvelserne. Der afsluttes med et projekt. Dansk.
Litteratur
Meddeles senere.
Skemaplacering (forelæsninger)
Blokpar A, mandag 8-10 + onsdag 8-10
Eksamensterminer
4. kvarter. Reeksamen: Efter aftale med forelæserne.
Udbyder
Kemisk Insktitut.
Indgår i følgende studieordninger
Bacheloruddannelsen i Medicinalkemi
Studieordning og bedømmelse
-
Indberetning, bedømt efter Bestået/ikke bestået med intern censur
Bestået/ikke bestået på baggrund af aktiv deltagelse og skriftlige rapporter/opgaver. Kurset afsluttes med en offentlig fremlæggelse af projektarbejdet.
