Vær opmærksom på at dette website indeholder et arkiv med historiske data. Det aktuelle kursuskatalog findes på kursuskatalog.au.dk

AU kursuskatalog arkiv

[Forside] [Hovedområder] [Perioder] [Udannelser] [Alle kurser på en side]

Fysisk biokemi 2 ( efterår 2007 - 5 ECTS )

Rammer for udbud

  • Uddannelsessprog: (se under Undervisnings- og arbejdsform)
  • Niveau: Grundkursus
  • Semester/kvarter: 2. kvarter.
  • Timer per uge: 7-14
  • Deltagerbegrænsning: Ingen.
  • Undervisningssted: Århus
  • Hovedområde: Det Naturvidenskabelige Fakultet
  • Udbud ID: 5817

Formål

Kurset giver den studerende elementær indsigt i principperne bag og anvendelse af gængse fysiske metoder i biokemi og molekylærbiologi.

Obligatorisk program

Laboratorieøvelserne

Indhold

Kurset beskriver principperne bag og anvendelse af fysiske teknikker i molekylærbiologi. Dette omfatter en beskrivelse af UV/Vis absorptionsspektrometri, fluorescensspektrometri, CD spektrometri, struktur og foldning af proteiner incl. differentiel skanning kalorimetri, kernemagnetisk resonans (NMR) spektroskopi, Röntgenkrystallografi, samt forskellige teknikker såsom lys- og elektronmikroskopi, konfocal og atomic force mikroskopi.

Læringsmål

Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

 

  • Redegøre for UV/VIS spektrometri og dens anvendelse til monitorering af reaktioner og separationer, og anvende simple beregninger til kvantificering af biologiske molekyler.
  • Redegøre for fluorescensspektrometri og cirkulærdikroisme og disses anvendelser til monitorering af biologiske reaktioner, herunder proteiners ligandbinding og konformationsændringer.
  • Redegøre for de fysiske principper for foldning og udfoldning af proteiner, herunder for metoder til bestemmelse af de indgående termodynamiske parametre. Redegøre for bestemmelse af foldnings- og udfoldningshastigheder for naturlige proteiner og mutanter heraf.
  • Redegøre for kernemagnetisk resonans (NMR) spektroskopi og dens anvendelse til bestemmelse af peptiders, oligonucleotiders, oligosacchariders og makromolekylers tredimensionelle struktur i opløsning og konformationelle fleksibilitet.
  • Redegøre for Röntgenkrystallografi og dens anvendelse til bestemmelse af den tredimensionelle struktur af makromolekyler samt komplekser heraf. Beskrive og opstille krystallisationseksperimenter.
  • Redegøre for lavvinkel Röntgenspredning af makromolekyler i opløsning og dens anvendelse til strukturstudier, hvor der foreligger Röntgenkrystallografiske data i nogen grad.
  • Redegøre for de forskellige former for mikroskopi, specielt lys- og elektronmikroskopi, konfokal mikroskopi og atomic force mikroskopi.

 

Faglige forudsætninger

1. år på en af molekylærbiologiuddannelserne eller tilsvarende, Fysisk biokemi 1.

Underviser

Ansvarshavende lærer
Navn: Lars Sottrup-Jensen
Universitetsadresse: Molekylærbiologisk Institut, Forskerparken, Gustav Wieds Vej 10C, 8000 Århus C
Telefonnummer: 8942 5051
E-mail: lsj@mb.au.dk

Øvrige lærere

Michael T. Overgaard, Thomas Boesen og Poul Nissen, Jens Dittmer
(KI).

Undervisnings- og arbejdsform

2x2 forelæsninger pr. uge i 6 uger
1x1 og 1x2 timers teoretiske øvelser pr. uge i 5 uger, metodedemonstrationer

2x5 timers øvelser i proteinoprensning og proteinkrystallisation

 

Materiale: Engelsk
Undervisningssprog: Dansk

Litteratur

Undervisningsmateriale
Noter udleveret i løbet af kurset

Supplerende materiale
Intet

Kursushjemmeside

Der henvises til Aarhus Universitets e-learningssider: http://www.aula.au.dk

Eksamensterminer

Eksamen: 2. kvarter
Reeksamen: August

Udbyder

Molekylærbiologisk Institut

Indgår i følgende studieordninger

Bacheloruddannelsen i Molekylærbiologi

Studieordning og bedømmelse

Bacheloruddannelsen i bioteknologi

  • Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur

Grundfaget i molekylærbiologi

  • Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur

Kandidatuddannelsen i medicinalkemi

  • Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur


  • 2 timers skriftlig eksamen uden hjælpemidler
  • 7-trinsskalaen 
  • intern censur