[Forside] [Hovedområder] [Perioder] [Udannelser] [Alle kurser på en side]
Deltagerne vil efter kurset have et indgående kendskab til genomdata og metoder til proteinstrukturforudsigelse. Dette indbefatter kendskab til hvilke typer genomdata der findes, hvorledes de forskellige typer data kan analyseres, hvilke strukturforudsigelsesmetoder der findes, hvor præcise de er og hvordan de anvendes. Kursets arbejdsform vil også træne deltagernes evne til at planlægge og praktisk gennemføre analyse af data samt formidle og kommunikere faglige problemstillinger.
Aktiv deltagelse i computerøvelser og godkendelse af to obligatoriske opgaver
Sekventering og samling af genomer; sammenligning af hele genomer (genome rearrangement); genfinding/annotering i prokaryoter og eukaryoter; genkortlægning (sygdomsassociationsstudier); RNA-elementer i genomet; mikroarray analyse (tiling arrays); sekundær og tertiær proteinstruktur forudsigelse; treading, homologimodellering og ab initio bestemmelse af protein struktur; analyse af forholdet mellem protein struktur og funktion, molekyldynamik.
Introduktion til bioinformatik eller 3 års molekylærbiologi- eller biologistudium
Mikkel Heide Schierup og Lea Thøgersen
Forelæsninger (3t/uge) Øvelser (3t/uge)
Artikler og lærebog (Marketa Zvelebil og Jeremy O. Baum: Understanding bioinformatics, Garland Science Taylor & Francis Group, 2008)
http://www.birc.au.dk/Studies/GAPS
Ordinær eksamen: Q2 Reeksamen: Efter aftale
Center for Bioinformatik (BiRC)
Via studiekontoret
Læringsmål Deltagerne skal ved afslutningen af kurset kunne: " Beskrive væsentlige problemstillinger i analysen af genomdata og proteinstrukturdata. " Forklare det teoretiske fundament for genomanalyse. " Forklare det teoretiske fundament for protein struktur forudsigelse. " Diskutere metoderne til protein struktur forudsigelse. " Diskutere originallitteratur indenfor området. " Anvende bioinformatiske værktøjer inden for de berørte emneområder.
Mundtlig eksamen uden forberedelse (20 min), 7-skala, intern censur
