Fysisk biokemi 2 ( efterår 2008 - 5 ECTS )
Rammer for udbud
-
Uddannelsessprog:
dansk
-
Niveau:
Grundkursus
-
Semester/kvarter:
2. kvarter.
-
Timer per uge:
7-14
-
Deltagerbegrænsning:
Ingen.
-
Undervisningssted:
Århus
-
Hovedområde:
Det Naturvidenskabelige Fakultet
-
Udbud ID:
12166
Formål
Kurset giver den studerende elementær indsigt i principperne bag og anvendelse af gængse fysiske metoder i biokemi og molekylærbiologi.
Obligatorisk program
Laboratorieøvelserne
Indhold
Kurset beskriver principperne bag og anvendelse af fysiske teknikker i molekylærbiologi. Dette omfatter en beskrivelse af UV/Vis absorptionsspektrometri, fluorescensspektrometri, CD spektrometri, struktur og foldning af proteiner incl. differentiel skanning kalorimetri, kernemagnetisk resonans (NMR) spektroskopi, Röntgenkrystallografi, samt forskellige teknikker såsom lys- og elektronmikroskopi, konfocal og atomic force mikroskopi.
Læringsmål
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:
-
Redegøre for UV/VIS spektrometri og dens anvendelse til monitorering af reaktioner og separationer, og anvende simple beregninger til kvantificering af biologiske molekyler.
-
Redegøre for fluorescensspektrometri og cirkulærdikroisme og disses anvendelser til monitorering af biologiske reaktioner, herunder proteiners ligandbinding og konformationsændringer.
-
Redegøre for de fysiske principper for foldning og udfoldning af proteiner, herunder for metoder til bestemmelse af de indgående termodynamiske parametre. Redegøre for bestemmelse af foldnings- og udfoldningshastigheder for naturlige proteiner og mutanter heraf.
-
Redegøre for kernemagnetisk resonans (NMR) spektroskopi og dens anvendelse til bestemmelse af peptiders, oligonucleotiders, oligosacchariders og makromolekylers tredimensionelle struktur i opløsning og konformationelle fleksibilitet.
-
Redegøre for Röntgenkrystallografi og dens anvendelse til bestemmelse af den tredimensionelle struktur af makromolekyler samt komplekser heraf. Beskrive og opstille krystallisationseksperimenter.
-
Redegøre for lavvinkel Röntgenspredning af makromolekyler i opløsning og dens anvendelse til strukturstudier, hvor der foreligger Röntgenkrystallografiske data i nogen grad.
-
Redegøre for de forskellige former for mikroskopi, specielt lys- og elektronmikroskopi, konfokal mikroskopi og atomic force mikroskopi.
Faglige forudsætninger
1. år på en af molekylærbiologiuddannelserne eller tilsvarende, Fysisk biokemi 1.
Underviser
Ansvarshavende lærer
Navn: Lars Sottrup-Jensen
Universitetsadresse: Molekylærbiologisk Institut, Forskerparken, Gustav Wieds Vej 10C, 8000 Århus C
Telefonnummer: 8942 5051
E-mail:
lsj@mb.au.dk
Øvrige lærere
Michael T. Overgaard, Thomas Boesen og Poul Nissen, Jens Dittmer
(KI).
Undervisnings- og arbejdsform
2x2 forelæsninger pr. uge i 6 uger
1x1 og 1x2 timers teoretiske øvelser pr. uge i 5 uger, metodedemonstrationer
2x5 timers øvelser i proteinoprensning og proteinkrystallisation
Materiale: Engelsk
Undervisningssprog: Dansk
Litteratur
Undervisningsmateriale
Noter udleveret i løbet af kurset
Supplerende materiale
Intet
Kursushjemmeside
Der henvises til Aarhus Universitets e-learningssider:
http://www.aula.au.dk
Eksamensterminer
Eksamen: 2. kvarter
Reeksamen: August
Udbyder
Molekylærbiologisk Institut
Indgår i følgende studieordninger
Bacheloruddannelsen i Molekylærbiologi, Molekylær medicin
Studieordning og bedømmelse
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur
-
2 timers skriftlig eksamen uden hjælpemidler - dog er standard elektronisk lommeregner tilladt
-
7-trinsskalaen
-
intern censur
