Videregående biokemi ( efterår 2008 - 10 ECTS )
Rammer for udbud
-
Uddannelsessprog:
dansk
-
Niveau:
Grundkursus
-
Semester/kvarter:
1. og 2. kvarter.
-
Timer per uge:
2-20
-
Deltagerbegrænsning:
Ingen
-
Undervisningssted:
Århus
-
Hovedområde:
Det Naturvidenskabelige Fakultet
-
Udbud ID:
12185
Formål
Kurset forventes at give den studerende et udvidet kendskab til proteinstruktur- og funktionsrelationer, intermediær metabolisme samt dennes regulering, og herigennem forståelse og løsning af biologiske problemer.
Ud over det rent faglige formål, lægges der i kurset op til en introducerende træning i den akademiske forskningstradition, hvor man tager ansvar for egen læring og faglige udvikling. Ifølge denne betragtes underviserne som vejledere fremfor lærere, og undervisningen, udtrykt i forelæsninger og teoretiske øvelser, som et tilbud der kan benyttes i samspil med lærebogen og andre informationskilder, f.ex. Internet.
Obligatorisk program
Laboratorie- og skærmøvelser.
Indhold
Kurset bygger videre på Almen biokemi og Almen molekylærbiologi og behandler følgende emner: Proteiners foldning, struktur, modifikation, sekretion og funktion. Enzymers katalytiske og regulatoriske egenskaber. Antistoffer og T-cellereceptorer. Opbygning af membraner samt protein targeting. Metabolisk omsætning af glycogen, aminosyrer, nukleotider og steroider.
Øvelserne supplerer den teoretiske del gennem oprensning samt strukturel og funktionel analyse af proteiner og indøver en forståelse af proteiners foldning og struktur ved hjælp af computerbaseret protein display program.
Læringsmål
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:
-
Gøre rede for katalytiske og regulatoriske mekanismer i enzymer, samt kunne genkende og klassificere enzymer ud fra deres biokemiske reaktion
-
Gøre rede for post-translatoriske modifikationer, hvorledes disse kommer i stand, og hvor i cellen dette foregår
-
Gøre rede for de forskellige typer af membranproteiner, sammensætning og struktur af membraner, samt de energetiske og kemiske forhold der gør sig gældende ved transport af molekyler over membranen
-
Gøre rede for de kemiske reaktionsmekanismer i proteaser, glycogenphosphorylase, aminotransferase og ribonucleotide reductase.
-
Gøre rede for metabolismen af glycogen, fedtsyrer, lipider, aminosyrer og nukleotider
-
Gøre rede for de forskellige organellers funktion i eukaryote celler
-
Gøre rede for de vigtigste organers biokemiske funktion i den menneskelige organisme
-
Gøre rede for de strukturelle og genetiske principper der er baggrund for det humorale og cellulære immunsystem
-
Beskrive resultaterne af enkle biokemiske eksperimenter, samt at fortolke og analysere disse i lyset af det teoretiske baggrundsstof
-
Gøre rede for grundlæggende eksperimentelle teknikker som gelelektrophorese, søjlekromatografi, isoelektrisk fokusering, radioaktiv mærkning, massespektrometri og mutagenese, og forklare formålet med disse teknikkers anvendelse
-
Foreslå et enkelt eksperimentelt forløb til belysning af en biokemisk problemstilling
-
Forklare enzymdefekters biokemiske effekt på metabolismen og fremsætte hypoteser om enzymdefekters fysiologiske virkning
-
Foretage enkle beregninger på grundlag af formler fra lærebogen.
-
Anvende IT-værktøjer til at analysere tredimensionelle strukturer af makromolekyler, herunder at kunne beskrive hvorledes et proteinmolekyle binder sit substrat eller kofaktor, og identificere sekundære, tertiære og kvaternære strukturelementer.
Faglige forudsætninger
Almen biokemi og Almen molekylærbiologi.
Underviser
Ansvarshavende lærer
Navn: Bjarne Jochimsen
Universitetsadresse: Molekylærbiologisk Institut, Forskerparken, Gustav Wieds Vej 10C, Bygn. 4, rum 110, 8000 Århus C
Telefonnummer: 8942 5039
E-mail:
bjoc@mb.au.dk
Øvrige lærere
Ditlev Brodersen, Michael Etzerodt, Hans Christian Thøgersen, Jan J. Enghild
Undervisnings- og arbejdsform
20 forelæsninger
28 teoretiske øvelser
40 laboratorieøvelser
Materiale: Dansk/Engelsk
Undervisningssprog: Dansk
Litteratur
Undervisningsmateriale
Lærebog: BIOCHEMISTRY, 6th edition (2007)
Forfattere: Berg, Tymoczko and Stryer
Udgivelsessted: W.H. Freeman and Company
ISBN Nr: 0-7167-8724-5
Supplerende materiale
Øvelsesvejledninger
Gamle eksamensopgaver
Kursushjemmeside
Der henvises til Aarhus Universitets e-learningssider:
http://www.aula.au.dk
Eksamensterminer
Eksamen: 2. kvarter
Reeksamen: august
Udbyder
Molekylærbiologisk Institut
Indgår i følgende studieordninger
Bacheloruddannelsen i Molekylærbiologi, Molekylær medicin
Indgår i følgende fagpakker
Molekylærbiologi 1, Molekylærbiologi 5
Studieordning og bedømmelse
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur
-
Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur
-
4 timers skriftlig eksamen med alle hjælpemidler
-
7-trinsskala
-
ekstern censur