[Forside] [Hovedområder] [Perioder] [Udannelser] [Alle kurser på en side]
Deltagerne vil efter kurset have detaljeret kendskab til algoritmer til sammenligning og analyse af biologiske sekvenser (DNA, RNA og protein), og praktisk erfaring med implementation af disse algoritmer. Endvidere vil deltagerne efter kurset kunne reflektere over algoritmiske løsninger i aktuelle problemstillinger inden for biologisk sekvensanalyse samt have erfaring med generalisering af disse til selvstændige algoritmiske problemer. Kursets arbejdsform vil også træne deltagernes evne til at planlægge og gennemføre projekter og til at formidle og kommunikere faglige problemstillinger.
To programmeringsprojekter samt fremlæggelse af aktuel forskningsartikel
Bioinformatik er en tværfaglig disciplin med fokus på udvikling og anvendelse af algoritmer og værktøjer til analyse af biologisk data. Meget effektive bioteknologiske metoder til indsamling af biologisk data betyder, at mængden af tilgængelig data vokser hurtigere end tilgængelig regnekraft. Analyse af den hastigt voksende datamængde kræver derfor særdeles effektive algoritmer og teknikker. Dette kursus dækker centrale algoritmiske problemer og teknikker til analyse af biologiske sekvenser. Kurset introducerer de underliggende biologiske spørgsmål og modeller, men fokuserer på algoritmiske problemer og teknikker i forbindelse med sammenligning af to eller flere biologiske sekvenser; søgning i sekvensdatabaser; genstruktur-forudsigelse; og analyse af hele genomer.
Deltagerne skal ved afslutningen af kurset kunne:
Christian Nørgaard Storm Pedersen
Forelæsninger (3t/uge)
Annonceres senere
http://www.daimi.au.dk/~cstorm/courses/AiBS
Oktober, reeksamen foregår efter aftale med underviseren
Datalogisk Institut og Center for Bioinformatik
Mundtlig eksamen uden forberedelse (30 min)
7-skala, intern censur
