Vær opmærksom på at dette website indeholder et arkiv med historiske data. Det aktuelle kursuskatalog findes på kursuskatalog.au.dk

AU kursuskatalog arkiv

[Forside] [Hovedområder] [Perioder] [Udannelser] [Alle kurser på en side]

Biostatistik ( efterår 2010 - 10 ECTS )

Rammer for udbud

  • Uddannelsessprog: (se under Undervisnings- og arbejdsform)
  • Niveau: Bachelorkursus (obligatorisk).
  • Semester/kvarter: 3. semester. Løber over 1. og 2. kvarter.
  • Timer per uge: 6 timer.
  • Deltagerbegrænsning: Ingen.
  • Undervisningssted: Århus
  • Hovedområde: Det Jordbrugsvidenskabelige Fakultet
  • Udbud ID: 22050

Formål

På kurset arbejder du med grundlæggende biostatistik og basal sandsynlighedsteori. Du bliver i stand til at udføre en simpel statistisk analyse af eksperimentelle undersøgelser med målinger, der er behæftet med tilfældig variation. Desuden gennemgår du eksempler på mere komplicerede design for forsøg.

Læringsmål

Ved afslutningen af kurset kan du:

  • opstille statistiske hypoteser der bygger på biologiske spørgsmål
  • identificere problemer med indsamling og analyse af data fra biologiske og andre jordbrugsrelaterede undersøgelser
  • identificere en passende statistisk model for typiske biologiske data og spørgsmål samt planlægge forsøg
  • udregne parameterestimater og -usikkerheder ud fra data
  • udføre basale grafiske fremstillinger af data
  • udføre modelkritik på den statistiske model
  • anvende et computerprogram til indlæsning af data og efterfølgende analyse ved hjælp af den statistiske model
  • rapportere resultaterne fra et eksperiment, herunder forklare og vurdere de statistiske analyseresultater i forhold til de biologiske spørgsmål
  • kende de væsentlige modelleringsforudsætninger for den statistiske analyse især betydningen af varianshomogenitet og uafhængighed mellem observationer

Indhold

På kurset lærer du om begreberne: sandsynligheder, stokastiske variable og deres fordeling, additivitet af sandsynligheder, samt uafhængighed mellem stokastiske variable for både kontinuerte og diskrete variable. Du kan beskrive de mest anvendte sandsynlighedsfordelinger såsom Binomial-, Poisson-, Normal- og t-fordeling. Du arbejder med statistiske modeller og kan beskrive modellernes parametre blandt andet middelværdi, varians og kovarians. Du arbejder med test af hypoteser på basis af statistiske modeller og teststørrelser samt om begreber som p-værdi og konfidensinterval, samt med metoder til at fastlæggelse af modellens parametre (estimation) ud fra data.  [fremhævet hvor skal skrives i aktiv sprog]Du vil komme til at arbejde med eksplorativ dataanalyse ved hjælp af grafiske metoder såsom: linjeplot, histogram, boxplot, fraktil-fraktil plot.Du opnår en grundlæggende viden om lineære regressionsmodeller. Du arbejde først med den generelle lineære model, hvoraf variansanalyse og lineær regression er specialtilfælde. Du fokuserer på det fundamentale princip bag opdeling af variation i data til besvarelse af spørgsmål vedrørende forskelle i middelværdier. Du vil møde de mest basale hierarkiske modeller (modeller med tilfældige effekter) og vil møde deres svagheder og styrker.Du vil blive præsenteret for en introduktion til design af eksperimenter. Her vil du finde ud af hvad gentagelse, pseudogentagelse, randomisering, en- og tovejs blokning, orthogonalitet både med kategoriske og kontinuerte variable, balancerede forsøg, faktorielle forsøg med vekselvirkninger betyder for et forsøg under planlæggelse. Du vil møde begrebet modelkontrol eller modelkritik, som skal anvendes ved alle former for dataanalyse. Herunder vil du se metoder til visualiseringer af antagelserne for generelle lineære modeller, såsom uafhængige data, varianshomogenitet, linearitet mellem den afhængige og uafhængige variable og normalfordelingsantagelse. Du vil her få kendskab til begreberne outlier og leverage punkter for forsøgsdata. Du vil opnå kendskab til gængse metoder til transformation af variable. Princippet for modeludvælgelse med tilhørende grafiske metoder er en naturlig del af kurset, herunder vil du opnå kendskab til fordele og ulemper ved forskellige modelselektionskriterier, få kendskab til tab af signifikansniveau ved multiple test og forskellige metoder til at imødegå dette. I øvelserne arbejder du med at anvende egnet statistisk software.

Faglige forudsætninger

Calculus 1 og 2 eller tilsvarende.

Underviser

Ulrich Halekoh (Ulrich.Halekoh@agrsci.dk) og Rasmus Froberg Brøndum (RasmusF.Brondum@agrsci.dk).

Undervisnings- og arbejdsform

Forelæsninger, obligatoriske øvelsesrapporter og computerøvelser blandt andet baseret på case-studier fra jordbrugsvidenskabelige forsøg.

Dansk. Undervisningsmateriale kan være engelsk.

Litteratur

  • Et nanokursus i statistik, Jens Ledet Jensen
  • Modern Statistics for the Life Sciences, Alan Grafen and Rosie Hails, Oxford (ISBN 0-19-925231-9)

Studieordning og bedømmelse

Bacheloruddannelsen i jordbrug, fødevarer og miljø, fødevarekvalitet

  • Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur

Bacheloruddannelsen i jordbrug, fødevarer og miljø, husdyrbiologi og produktion

  • Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur

Bacheloruddannelsen i jordbrug, fødevarer og miljø, jordbrug og miljø

  • Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur

Bacheloruddannelsen i jordbrug, fødevarer og miljø, planteproduktion

  • Skriftlig, bedømt efter 7-skala med intern censur


4 timers skriftlig eksamen med alle normale hjælpemidler. Kurset evalueres efter 7-trinsskalaen med intern censur.

Deltagelse i eksamen forudsætter godkendte øvelsesrapporter.