AU kursuskatalog arkiv

Enzymologi og makromolekylær kinetik (Q2) ( efterår 2010 - 5 ECTS )

Rammer for udbud

• Uddannelsessprog: engelsk (eller dansk)
• Niveau: Bachelorkursus
• Semester/kvarter: 2. kvarter - næste gang 3. kvarter F2012
• Timer per uge: 5
• Deltagerbegrænsning: Ingen
• Undervisningssted: Århus
• Hovedområde: Det Naturvidenskabelige Fakultet
• Udbud ID: 25894

Formål

Kurset har til formål at give deltagerne en dyberegående indsigt i enzymers kinetik og andre kinetiske fænomener forbundet med proteiners struktur, deriblandt anvendelser til bioteknologiske processer og sygdomsfremkaldende ændringer. Der vil også blive lagt vægt på grundlæggende databehandlingsmetoder.

Obligatorisk program

TØ, LØ samt artikelgennemgang og computerøvelser.

Indhold

Kinetiske måleteknikker. Protein engineering. Måling af enzymstabilitet. Kinetik forbundet med proteinstruktur: foldning og aggregering. Proteiner der virker på uopløselige substrater. Generelle principper for matematisk analyse af kinetiske data. Den molekylære baggrund for forskellige kinetiske uni- og bimolekylære reaktionstyper, udledning af de tilhørende ligninger og computersimulering. Bimolekylære reaktioner og deres faldgruber. Typisk enzymkinetik, mono- og bisubstrat reaktioner, inhibering, aktivering og kooperativitet. Laboratorieøvelser til praktisk måling af enzym kinetik og anden makromolekylær kinetik. Anvendelse af industrielle enzymer i praksis.

Faglige forudsætninger

Videregående biokemi og Fysisk biokemi 1

Underviser

Ansvarshavende lærer

Navn: Daniel Otzen
Universitetsadresse: MBI, Forskerparken, bygning 2, 2. etage, rum 13
Telefonnummer: 89 42 50 46
E-mail: dao@inano.dk

Øvrige lærere

Sergey N. Fedosov

Undervisnings- og arbejdsform

3 F +2TØ/LØ pr. uge på 2. kvarter.
Forelæsninger over lærebog og originallitteratur, computerøvelser, opgaveregning til TØ og praktiske laboratorieøvelser med tilhørende rapporter.

Litteratur

Alejandro G. Marangoni: Enzyme kinetics. A Modern Approach. Wiley Interscience 2003. ISBN 0-471-15985-9.

Kapitler fra: Alan R. Fersht: Structure and Mechanism in Protein Science: A guide to enzyme catalysis and protein folding. W.H. Freeman, New York 1999.

Udleverede noter.

Originallitteratur.

Mht. relevant matematisk baggrundsviden anbefales: Athel Cornish-Bowden: Basic Mathematics for Biochemists. Oxford University Press, 1999. ISBN-13: 9780198502166.

Kursushjemmeside

Der henvises til Aarhus Universitets e-learningssider: http://www.aula.au.dk

Eksamensterminer

Eksamen: Efter 2. kvarter
Reeksamen: Efter aftale

Udbyder

Molekylærbiologisk Institut

Særligt om dette kursus

Næste gang 3. kvarter 2012

Læringsmål

Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

• Udlede ligninger svarende til forskellige enzymatiske reaktionsmekanismer
• Analysere hvordan inhibitorer og aktivatorer kan påvirke disse mekanismer
• Foreslå relevante kinetiske målemetoder til at studere en given reaktion og analysere de dermed forbundne data
• Identificere de mest hensigtsmæssige måder at forbedre enzymatiske systemers produktionsevner.
• Gøre rede for hvordan kinetisk og termodynamisk stabilitet kan påvirke enzymatisk produktivitet.

Bedømmelse

• 2 timers skriftlig eksamen uden hjælpemidler bortsat fra skrivemidler og lommeregner
• Bedømmelse efter 7-trinsskalaen
• Ekstern censur