Vær opmærksom på at dette website indeholder et arkiv med historiske data. Det aktuelle kursuskatalog findes på kursuskatalog.au.dk

AU kursuskatalog arkiv

[Forside] [Hovedområder] [Perioder] [Udannelser] [Alle kurser på en side]

Udfordringer i bioinformatik - H (Q1) ( efterår 2011 - 5 ECTS )

Rammer for udbud

  • Uddannelsessprog: engelsk (eller dansk)
  • Niveau: Kandidatkursus.
  • Semester/kvarter: Q1.
  • Timer per uge: 6  
  • Deltagerbegrænsning: Ingen.
  • Undervisningssted: Århus
  • Hovedområde: Det Naturvidenskabelige Fakultet
  • Udbud ID: 31484

Formål

Efter kurset skulle den studerende have viden om væsentlige udfordringer i computational biologi og bioinformatik. Dette vil inkludere kendskab til hovedoråderne indenfor computational biologi og bioinformatik. Endvidere vil den studerende efter kurset kunne reflektere over løsninger af aktuelle problemstillinger inden for computational biologi og bioinformatik samt have erfaring med generalisering af disse til andre problemstillinger indenfor feltet. Arbejdstilgangen vil være samarbejde over nogle fælles projekter, som vil implicere analyse af et problem, littratursøgning, implementation og analyse af algoritmer og modeller. Det er fx. muligt at undersøge en ny ide eller et nyt interesseområde relateret til et kommende kandidat-eller ph.d.-projekt.

Obligatorisk program

Projekt report samt fremlæggelse af aktuel forskningsartikel.

Indhold

Dobbeltforelæsningerne vil have titlerne: Modeller af subsitution, Fylogneier, Coalescent Teori, Statistisk Alignment Algoritmer, Genom Annotering, Signaler i sekvenser, Netværk.  Forelæsninger og projektforeslag vil vœre tilgœngelig før kursusstart.  Kurset stiler mod kandidat- og bachelorstuderende fra naturvidenskab med en god kvantitativ baggrund. Projektarbejdet vil bliver gjort af de studerende med fokus på åbne problemer i computational biologi og bioinformatik. 

Faglige forudsætninger

Første 2 år af et bachelorprogram i naturvidenskab og grundlæggende programmeringsfærdigheder (Introduktion til Programmering, Anvendt Programmering eller tilsvarende).

Underviser

Jotun Hein.

Undervisnings- og arbejdsform

Forelæsninger (2 t/uge).
Projektdiskussion (2 t/uge)

Litteratur

Forelæsningsslides og anbefalet literatur: ca 15-40 sider per uge.

Kursushjemmeside

http://www.birc.au.dk/CiB

Eksamensterminer

Ordinær eksamen: Q1.
Reeksamen: Efter aftale med faglærer.

Udbyder

Center for Bioinformatik (BiRC).

Tilmelding til undervisning

Via studiekontoret.

Særligt om dette kursus

Intet.

Læringsmål

Læringsmål

Efter kurset skulle den studerend være i stand til:

  • Beskrive overordnede problemområder i computational biology.
  • Diskutere hovedområder i computational biology.
  • Demonstrere problemløsningserfaring.
  • Relatere original literatur til et hovedområde i computational biology.
  • Bruge bioinformatik redskaber indenfor udvalgte anvendelsesområder.
  • Reflektere over løsninger af aktuelle problemstillinger inden for computational biologi.
  • Generalisere løsninger af aktuelle problemstillinger inden for computational biologi til andre problemsstillinger indenfor feltet.

Bedømmelse

Mundtlig eksamen uden forberedelse (30 min), 7-trin skala, intern censur.