Fysisk biokemi 2 (Q2) ( efterår 2011 - 5 ECTS )
Rammer for udbud
-
Uddannelsessprog:
dansk
-
Niveau:
Grundkursus
-
Semester/kvarter:
2. kvarter.
-
Timer per uge:
7-14
-
Deltagerbegrænsning:
Ingen.
-
Undervisningssted:
Århus
-
Hovedområde:
Det Naturvidenskabelige Fakultet
-
Udbud ID:
31310
Formål
Kurset giver den studerende elementær indsigt i principperne bag og anvendelse af gængse fysiske metoder i biokemi og molekylærbiologi.
Obligatorisk program
Laboratorieøvelserne
Indhold
Kurset beskriver principperne bag og anvendelse af fysiske teknikker i molekylærbiologi. Dette omfatter en beskrivelse af UV/Vis absorptionsspektrometri, fluorescensspektrometri, CD spektrometri, struktur og foldning af proteiner incl. differentiel skanning kalorimetri, kernemagnetisk resonans (NMR) spektroskopi, Röntgenkrystallografi, samt forskellige teknikker såsom lys- og elektronmikroskopi og konfocal og mikroskopi.
Læringsmål
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:
-
Redegøre for sinus(kosinus)bølger, elektromagentiske bølger og deres udbredelse, interferens af elektromagnetiske bølger, fase og faseforskel, brydningsindeks og diffraktionsgitteret.
-
Redegøre for UV/VIS spektrometri og dens anvendelse til monitorering af reaktioner og separationer, og anvende simple beregninger til kvantificering af biologiske molekyler.
-
Redegøre for fluorescensspektrometri og cirkulærdikroisme og disses anvendelser til monitorering af biologiske reaktioner, herunder proteiners ligandbinding og konformationsændringer.
-
Redegøre for de fysiske principper for foldning og udfoldning af proteiner, herunder for metoder til bestemmelse af de indgående termodynamiske parametre. Redegøre for bestemmelse af foldnings- og udfoldningshastigheder for naturlige proteiner og mutanter heraf.
-
Redegøre for kernemagnetisk resonans (NMR) spektroskopi og dens anvendelse til bestemmelse af peptiders, oligonucleotiders, oligosacchariders og makromolekylers tredimensionelle struktur i opløsning og konformationelle fleksibilitet.
-
Redegøre for Röntgenkrystallografi og dens anvendelse til bestemmelse af den tredimensionelle struktur af makromolekyler samt komplekser heraf. Beskrive og opstille krystallisationseksperimenter.
-
Redegøre for de forskellige former for mikroskopi, specielt lys- og elektronmikroskopi og konfokal mikroskopi.
Faglige forudsætninger
1. år på en af molekylærbiologiuddannelserne eller tilsvarende, Fysisk biokemi 1.
Underviser
Ansvarshavende lærer
Navn: Lars Sottrup-Jensen
Universitetsadresse: Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Forskerparken, Gustav Wieds Vej 10C, bygning 4 (3135), rum 2.04.
8000 Aarhus C
Telefonnummer: 8942 5051
E-mail:
lsj@mb.au.dk
Undervisnings- og arbejdsform
2x2 forelæsninger pr. uge i 6 uger
1x1 og 1x2 timers teoretiske øvelser pr. uge i 5 uger, metodedemonstrationer
2x2 timers øvelser i proteinkrystallisation
Litteratur
Undervisningsmateriale
Forelæsningsnoter, opgaver til teoretiske øvelser og vejledning til laboratorieøvelser kan købes i Universitetsboghandlen en uge før kursusstart.
Supplerende materiale
Intet
Kursushjemmeside
Der henvises til Aarhus Universitets e-learningssider:
http://www.aula.au.dk
Eksamensterminer
Eksamen: 2. kvarter
Placering: mandag d 2. januar 2012, uge 1
Reeksamen: August
http://science.au.dk/uddannelse/undervisning/eksamen/regler-for-tilmelding-til-kurser-med-fastlagt-eksamen/
Udbyder
Institut for Molekylærbiologi og Genetik
Indgår i følgende studieordninger
Bacheloruddannelsen i Molekylærbiologi, Molekylær medicin
Bedømmelse
-
2 timers skriftlig eksamen uden hjælpemidler - dog er standard elektronisk lommeregner tilladt
-
7-trinsskalaen
-
ekstern censur
