AU kursuskatalog arkiv

RNomics (Q1) ( efterår 2011 - 5 ECTS )

Rammer for udbud

• Uddannelsessprog: engelsk (eller dansk)
• Niveau: Kandidatkursus
• Semester/kvarter: 1. kvarter
• Timer per uge: 4 (se Undervisnings- og arbejdsform)
• Deltagerbegrænsning: Ingen      
• Undervisningssted: Århus
• Hovedområde: Det Naturvidenskabelige Fakultet
• Udbud ID: 19141

Formål

Formålet med kurset er at give de studerende et indblik i struktur og funktion af ikke-kodende RNAer i mammale celler samt de bioteknologiske og terapeutiske anvendelsesmuligheder disse har givet anledning til.

Indhold

Gennemgang af de vigtigste ikke-kodende RNA-grupper (small interfering RNA, microRNA, small nucleolar RNA, riboswitches) og de processer de er involveret i (RNA-katalyse, RNA-interference, RNA-modifikation, RNA-editing) samt udbredelsen af alternativ RNA-splejsning i højerestående eukaryoter. Desuden gennemgåes nye sekventeresmetoder til 'deep sequencing' af organismer og bioteknologiske anvendelser af RNA (In vitro evolution af aptamerer og ribozymer, terapeutisk RNAi og nukleinsyre baserede nanosensorer). Endelig vil vi diskutere mulighederne for in silico metoder til at analysere RNA sekvens og struktur (RNA bioinformatics).

Læringsmål

• Gøre rede for struktur og funktion af ikke-kodende RNA inden for de
  vigtigste RNA hovedgrupper, herunder cellulær funktion og hvilke
  komponenter i cellen de spiller sammen med.
• Gøre rede for fænomenet alternativ RNA splejsning og diskutere hvordan dette
  bidrager til kompleksiteten i mRNA populationen hos højerestående eukaryoter
• Forklare RNA interference og beskrive de involverede cellulære
  komponenter , samt sammenligne RNA interference i højere og lavere
  eukaryoter.
• Gøre rede for eksempler på ikke-virale og virale teknikker til at
  indføre small interfering RNA i celler og hele dyr
• Forklare struktur og funktion af small nucleolar RNAer og deres rolle
  i cellen
• Perspektivere virkningsmekanismen af riboswitches ved gennemgang af udvalgte
  eksempler
• Reflektere over hvad SELEX/in vitro evolution metoden indebærer og gennemgå
  udvalgte eksempler på hvad metoden kan anvendes til
• Beskrive metoder til at anvende oligonukleotider til fremstilling af
  biosensorer, herunder molekylære beacons og princippet for 'fluorescence
  resonance energy transfer' (FRET), samt selvorganiserende netværk på
  overflader.
• Forudsige konsekvenser og foreslå forbedringer til eksperimentelle
  fremgangsmåder beskrevet i original litteratur

Faglige forudsætninger

Bestået bachelor i molekylærbiologi

Underviser

Ansvarshavende lærer
Navn: Jørgen Kjems
Universitetsadresse: Institut for Molekylærbiologi og Genetik, C.F. Møllers Allé 3, Byg 1130, 8000 Aarhus C
Telefonnummer: 8942 2686
E-mail: jk@mb.au.dk

Øvrige lærere
Jesper Bramsen, Lu Sang, Thomas Hansen, Sune Villadsen, Erik Wiklund, Ebbe S. Andersen

Undervisnings- og arbejdsform

7x2 forelæsninger og studenteroplæg
7x2 teoretiske øvelser /workshop

Litteratur

Undervisningsmateriale
Original artikler og reviews (udleveres)

Supplerende materiale
Spørgsmål og workshop materialer (udleveres)

Kursushjemmeside

Der henvises til Aarhus Universitets e-læringssider: http://www.aula.au.dk

Eksamensterminer

Eksamen: efter 1. kvarter
Reeksamen: Efter aftale med faglærer

Udbyder

Institut for Molekylærbiologi og Genetik 

Særligt om dette kursus

Fra 2011 afholdes dette kursus i 1. kvarter.

Bedømmelse

• 4-timers skriftlig eksamen med alle sædvanlige hjælpemidler incl. PC som opslagsværk med spørgsmål baseret på en original artikel, der udleveres 3 døgn før eksamen
• 7-trinsskala
• Ekstern censur

Det skal præciseres, at PC her alene kan anvendes som avanceret lommeregner - ikke som tekstbehandlingsværktøj med mulighed for udskrivning. Opgavebesvarelsen udarbejdes altså i hånden