[Forside] [Hovedområder] [Perioder] [Udannelser] [Alle kurser på en side]
TØ samt artikelgennemgang og computerøvelser.
Med udgangspunkt i den klassiske dobbelthelix udbygges indsigten i nukleinsyrers konformation med en detaljeret beskrivelse af fleksibilitet, topologi og organisation fra det molekylære til det cellulære plan. Herunder bl.a. basens og sukkergruppens konformationer, forskellige isoformer af DNA, base-mismatches, supercoiling og højereordens struktur af kromatin og genomer. Dernæst fokuseres der på forskellene på DNA og RNA, samt RNAs konformationer og funktioner i biologien, bl.a. transfer-, ribosomal- og messenger-RNA, RNA-strukturmotiver, ribozymer og ribosomet. Kurset dækker også biologisk og kemisk syntese af nukleinsyrer samt brug af nukleinsyrer indenfor bioteknologi. Essentielle, biologiske processer hvor nukleinsyrer indgår, såsom replikation og transkription, RNA-splicing og -eksport, proteinsyntese samt RNA-degradering og -surveillance gennemgås ligeledes med fokus på nukleinsyrerens struktur og betydning. Kurset indeholder desuden en beskrivelse af både non-kovalente og kovalente modifikationer af nukleinsyrer, både naturligt forekommende samt dem, der anvendes eksperimentelt i laboratoriet, herunder bl.a. DNA-metylering og epigenetik, RNA cross-linking, radikalprobning og protein foot-printing. Herudover vil interaktioner mellem nukleinsyrer og små og store molekyler, bl.a. interaktioner med vand, ioner, interkalerende molekyler, og specifik og non-specifik genkendelse af proteiner blive behandlet.
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:
·
beskrive struktur og konformation af nukleinsyrer (DNA & RNA) fra det molekylære til det cellulære niveau, og anvende de strukturelle parametre, der definerer dette til simple beregninger.
·
sammenfatte metoder til syntese af nukleinsyrer, både biologisk forekommende såvel som syntetiske.
·
beskrive eksperimentelle metoder til probning og bestemmelse af nukleinsyrers struktur og forklare deres individuelle styrker og svagheder.
·
argumentere for hvordan proteiner kan genkende nukleinsyrer og analysere protein-nukleinsyreinteraktioner baseret på strukturelle data.
·
forklare virkningen af kemiske stoffer, der interagerer kovalent og ikke-kovalent med nukleinsyrer, samt forudsige virkningen af ukendte stoffer. Beskrive de cellulære og fysiologiske effekter af modifikationer fra sådanne stoffer, samt vurdere deres anvendelighed som medicinske præparater.
·
beskrive og analysere måder, hvorpå RNA kan have en aktiv katalytisk rolle i biokemiske reaktioner, og generalisere disse. Forklare forskellige biologiske funktioner af ikke-kodende RNA.
·
analysere originale videnskabelige data og bedømme deres relevans og relation til det kendte stof, specielt med henblik på strukturelle informationer.
·
diskutere, kritisere og konkludere med baggrund i forelagte videnskabelige data, specielt med henblik på strukturelle informationer.
Ansvarlig faglærer
Navn: Ditlev E. Brodersen
Universitetsadresse: MBI, Forskerparken, bygning 3120 (barak 12), Gustav Wieds Vej 10C, 8000 Århus C
Telefon: 8942 5259
E-mail:
deb@mb.au.dk
2 F + 4 TØ pr. uge fordelt på 3. og 4. kvarter. Forelæsninger over lærebog og originallitteratur, inviterede foredragsholdere, studenterpræsentationer, samt computerøvelser og opgaveregning til TØ.
Kursuskompendium
Ordinær eksamen: Efter 4. kvarter.
Reeksamen efter aftale med den ansvarlige faglærer.
