Molekylær populationsgenetik ( forår 2009 - 5 ECTS )
Rammer for udbud
-
Uddannelsessprog:
engelsk
-
Niveau:
Overbygningskursus
-
Semester/kvarter:
4. kvarter
-
Timer per uge:
7
-
Deltagerbegrænsning:
Ingen
-
Undervisningssted:
Århus
-
Hovedområde:
Det Naturvidenskabelige Fakultet
-
Udbud ID:
14000
Formål
-
At vise hvordan molekylærgenetisk variation kan anvendes til studier af evolutionære processer i naturlige populationer
-
At præsentere den nødvendige populationsgenetiske baggrund for forståelse af disse processer
Indhold
-
Dataanalyse diskuteres på basis af "The Coalescent", som giver en statistisk beskrivelse af genealogien for observeret genetisk variation. En række metoder præsenteres og diskuteres blandt andet ved læsning af original-artikler
-
Den basale coalescent-teori introduceres og relateres til klassiske teorier for tilfældig genetisk drift. Teorierne udvides med effekter af mutation, rekombination, immigration, populationsstruktur og selektion
-
Indirekte effekter af selektion belyses ved diskussion af indavlsdepression og selektion på variation i flere loci
-
Påvisning af introgression fra hominider til menneske ved hjælp af sekvensvariation
-
Hybridisering og introgression i planter
-
Palæopopulationsgenetik af mennesker og menneskeaber
-
Lokalisering og identifikation af sygdomsgener hos mennesket ved hjælp af SNP-variation
-
Computere anvendes både til visualisering af modeller og til dataanalyse
Læringsmål
Når kurset er færdigt, forventes den studerende at kunne:
-
Relatere populationsvariation i DNA-sekvenser til evolutionære processer i natulige populationer
-
Forklare populationsgenetiske begrebers biologiske baggrund
-
Ræsonnere sig frem til populationsgenetiske beskrivelser af observerede fænomener
-
Bedømme populationsgenetiske fortolkninger af dna-sekvensdata
Faglige forudsætninger
Basale kurser i genetik og molekylær evolution (kontakt evt. forelæserne)
Underviser
Freddy Bugge Christiansen
og Mikkel Schierup
Undervisnings- og arbejdsform
Ugentlige 4 timers forelæsninger, 3 timers teoretiske øvelser, computerøvelser, og kollokvier i 7 uger
Litteratur
-
2007: F. B. Christiansen: "Lecture Notes in Population Genetics"
-
F. B. Christiansen: "Theories of Population Variation in Genes and Genomes", Princeton University Press (udkommer 2008).
-
Udleveret øvelsesmateriale og tidskriftsartikler
Kursushjemmeside
www.aula.au.dk
Eksamensterminer
Ordinær eksamen: 4. kvarter
Reeksamen: Efter aftale med faglærer
Udbyder
Biologisk Institut
Indgår i følgende fagpakker
Genetik og evolution
Studieordning og bedømmelse
-
Mundtlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur
-
Mundtlig eksamen, 20 minutter med 20 minutters forberedelse
-
7-trinsskalaen
-
Ekstern censur
