[Forside] [Hovedområder] [Perioder] [Udannelser] [Alle kurser på en side]
Kurset har til formål at give deltagerne en dyberegående indsigt i nukleinsyrers konformation og funktion fra nukleotidniveau til højereordens strukturer, samt at belyse hvordan nukleinsyrer genkendes og fungerer i biologiske systemer.
Eksamen forudsætter deltagelse i TØ og computerøvelser samt mindst én studenterpræsentation ved artikelkollokvier.
.
Med udgangspunkt i den klassiske dobbelthelix udbygges indsigten i nukleinsyrers konformation med en detaljeret beskrivelse af fleksibilitet, topologi og organisation fra det molekylære til det cellulære plan. Herunder bl.a. basens og sukkergruppens konformationer, forskellige isoformer af DNA, base-mismatches, supercoiling og højereordens struktur af kromatin og genomer. Dernæst fokuseres der på forskellene mellem DNA og RNA, samt RNAs konformationer og funktioner i biologien, bl.a. transfer-, ribosomal- og messenger-RNA, RNA-strukturmotiver, ribozymer og ribosomet. Kurset dækker også biologisk og kemisk syntese af nukleinsyrer samt syntetisk modifikation af nukleinsyrer. Kurset indeholder desuden en beskrivelse af både non-kovalente og kovalente modifikationer af nukleinsyrer, både naturligt forekommende samt dem, der anvendes eksperimentelt i laboratoriet, herunder bl.a. DNA-metylering og epigenetik, RNA-editing, RNA cross-linking, radikalprobning og protein foot-printing. Herudover vil interaktioner mellem nukleinsyrer og små og store molekyler, bl.a. interaktioner med vand, ioner, interkalerende molekyler, og specifik og non-specifik genkendelse af proteiner blive behandlet.
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:
· beskrive struktur og konformation af nukleinsyrer (DNA & RNA) fra det molekylære til det cellulære niveau, og anvende de strukturelle parametre, der definerer dette til simple beregninger.
· sammenfatte metoder til syntese af nukleinsyrer, både biologisk forekommende såvel som syntetiske samt angive simple metoder til syntetisk modifikation af nukleinsyrer.
· beskrive eksperimentelle metoder til probning og bestemmelse af nukleinsyrers struktur og forklare deres individuelle styrker og svagheder.
· argumentere for hvordan proteiner kan genkende nukleinsyrer og analysere protein-nukleinsyreinteraktioner baseret på strukturelle data.
· forklare virkningen af kemiske stoffer, der interagerer kovalent og ikke-kovalent med nukleinsyrer, samt forudsige virkningen af ukendte stoffer. Beskrive de cellulære og fysiologiske effekter af modifikationer fra sådanne stoffer, samt vurdere deres anvendelighed som medicinske præparater.
· beskrive og analysere måder, hvorpå RNA kan have en aktiv katalytisk rolle i biokemiske reaktioner, og generalisere disse. Forklare forskellige biologiske funktioner af ikke-kodende RNA.
· analysere originale videnskabelige data og bedømme deres relevans og relation til det kendte stof, specielt med henblik på strukturelle informationer.
· diskutere, kritisere og konkludere med baggrund i forelagte videnskabelige data, specielt med henblik på strukturelle informationer.
Enten Videregående biokemi eller Videregående molekylærbiologi (tilmeldt eller bestået eksamen).
Ansvarlig faglærer
Navn: Ditlev E. Brodersen
Universitetsadresse: MBI, Forskerparken, bygning 3120 (barak 12), Gustav Wieds Vej 10C, 8000 Århus C
Telefon: 8942 5259
E-mail:
deb@mb.au.dk
Øvrige undervisere
Mikkel Fog Jacobsen (Kemisk Institut) og Anette Thyssen Jonstrup
2 F + 4 TØ pr. uge fordelt på 3. og 4. kvarter. Forelæsninger over lærebog og originallitteratur, inviterede foredragsholdere, studenterpræsentationer, samt computerøvelser og opgaveregning til TØ.
Sprog:
Materiale: Engelsk
Undervisningssprog: Dansk hvis der kun er tilmeldt dansktalende studerende ellers engelsk.
Lærebog: NUCLEIC ACIDS IN CHEMISTRY AND BIOLOGY, 3. udgave, 2006
Forlag: Royal Society of Chemistry Publishing
ISBN: 0 85404 654 2
Kursuskompendium
Der henvises til Aarhus Universitets e-learningsider: http://www.aula.au.dk
Ordinær eksamen: Efter 4. kvarter.
Reeksamen: August
Molekylærbiologisk Institut
