AU kursuskatalog arkiv

Proteinkrystallografi 1 ( forår 2009 - 5 ECTS )

Rammer for udbud

• Uddannelsessprog: engelsk (eller dansk)
• Niveau: Kandidatkursus
• Semester/kvarter: 3. kvarter
• Timer per uge: 7
• Deltagerbegrænsning: Højst 24 deltagere. Minimum 6 tilmeldte kræves for kursets afholdelse.
• Undervisningssted: Århus
• Hovedområde: Det Naturvidenskabelige Fakultet
• Udbud ID: 13790

Formål

Dette kursus beskriver de grundlæggende principper i og implementeringen af røntgen-krystallografi i strukturbestemmelse af biologiske makromolekyler.

Obligatorisk program

TØ, LØ og CØ og afleveringsopgaver.

Indhold

Hovedvægten ligger på den grundlæggende teori bag basale krystallografiske metoder som krystallisation og strukturbestemmelse. Fundamental krystallografisk teori, såsom krystalsystemer, krystalsymmetri, og spredning/diffraktion af røntgenstråling bliver gennemgået. Kurset vil dertil dække principper i fasebestemmelse ved brug af isomorf substitution, og introducere procedurer for tolkning af elektrontæthedskort, grafisk modelbygning, modelforfining, og grafisk repræsentation af strukturelle data.

Kurset giver studenten den nødvendige baggrund for at forstå krystallografi som en vigtig og integreret metode i kontemporær biovidenskab og giver den studerende praktisk erfaring med krystallisation af makromolekyler og opsamling og processering af røntgendiffraktionsdata.

Læringsmål

Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

· beskrive overordnede principper for krystallografisk strukturbestemmelse af biologiske makromolekyler

· beskrive krystalsystemer og symmetrioperationer i makromolekylær krystallografi

· redegøre for strukturfaktorer og elektrontæthedsfunktionen i krystallografi

· redegøre for principper i strukturløsning ved isomorf substitution

· redegøre for Patterson funktioner og deres rolle i strukturløsning af makromolekyler

· udføre og evaluere af krystallisationsforsøg af makromolekyler

· udføre opsamling og processering af røntgendiffraktionsdata på makromolekylære krystaller

· udføre simple beregninger på basis af krystalsystemer, symmetrioperationer, Bragg's lov, og Harker konstruktioner

Faglige forudsætninger

Videregående biokemi (tidligere Biokemi A) (tilmeldt eller bestået eksamen).

Underviser

Ansvarlig faglærer

Poul Nissen
Molekylærbiologisk Institut, Aarhus Universitet, Forskerparken
Blok 12, rum 110, Gustav Wieds Vej 10C, 8000 Århus C
Tlf: 8942 5025
E-post: pn@mb.au.dk

Øvrige lærere

Thomas Boesen, Jens Preben Morth og gæsteforelæsere

Undervisnings- og arbejdsform

2 F +1 TØ + 4 LØ/CØ pr. uge fordelt på 3. kvarter. Forelæsninger over lærebog og note-materiale(kompendium indeholdende oversigtsartikler og øvelsesnoter), opgaveregning til TØ samt laboratorie- og computerøvelser.

Sprog:  

Materiale: engelsk
Forelæsninger: Dansk, såfremt der ikke er fremmedsprogede studerende, ellers engelsk.

Litteratur

Gale Rhodes, "CRYSTALLOGRAPHY MADE CRYSTAL CLEAR", Academic Press, 3. udgave, 2006, ISBN: 0-12-587073-6.

Udleverede noter (kompendium)

Kursushjemmeside

http://www.aula.au.dk/courses/CL3ffb/

Eksamensterminer

Eksamen: 3. kvarter

Reeksamen: efter aftale med faglærer

Udbyder

Molekylærbiologisk Institut

Bedømmelse

• To-timers skriftlig eksamen bestående af multiple choice test og opgaver uden hjælpemidler
• Ekstern censur
• 7-trinsskala