AU kursuskatalog arkiv

Proteinkrystallografi 2 ( forår 2009 - 5 ECTS )

Rammer for udbud

• Uddannelsessprog: engelsk (eller dansk)
• Niveau: Kandidatkursus
• Semester/kvarter: 4. kvarter
• Timer per uge: 7
• Deltagerbegrænsning: Højst 24 deltagere. Minimum 6 tilmeldte kræves for kursets afholdelse.
• Undervisningssted: Århus
• Hovedområde: Det Naturvidenskabelige Fakultet
• Udbud ID: 13796

Formål

Dette kursus giver et detaljeret indblik i teorien bag og implementeringen af makromolekylær røntgen-krystallografi på et videregående niveau. Avancerede metoder i kontemporær røntgenkrystallografi introduceres.

Obligatorisk program

TØ, CØ og afleveringsopgaver.

Indhold

Avancerede metoder anvendt i makromolekylær krystallografi bliver beskrevet detaljeret. Kurset vil dertil dække principper og praktiske øvelser i fasebestemmelse, tolkning af elektrontæthedskort, grafisk modelbygning, modelforfining, og grafisk repræsentation af strukturelle data. Endelig bliver brugen af krystallografiske metoder i et bredere perspektiv introduceret.

Kurset giver studenten en baggrund for at forstå og anvende krystallografi som en integreret metode i kontemporær biovidenskab og giver den studerende et mere indgående kendskab til krystallografi og praktisk erfaring med løsning af faseproblemet, elektrontæthedsberegning, modelbygning, modelvalidering og strukturanalyse.

Læringsmål

Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

· redegøre for strukturbestemmelse ved isomorf substitution, anomal diffraktion og molecular replacement

· redegøre for strukturel repræsentation ved atomar model og evaluering af denne

· udføre beregninger til løsning af faseproblem ved isomorf substitution, anomal diffraktion og molecular replacement

· beregne og anvende elektrontæthedskort til fremstilling af atomare modeller og strukturel analyse

· evaluere og analysere atomare modeller

· sammenligne og vurdere tilgængelige strategier i strukturbestemmelse af makromolekyler i specifik sammenhæng

· diskutere og evaluere strukturbestemmelse på basis af original, videnskabelig litteratur

Faglige forudsætninger

Proteinkrystallografi 1 eller ækvivalente kurser.

Underviser

Ansvarlig faglærer

Poul Nissen
Molekylærbiologisk Institut, Aarhus Universitet, Forskerparken
Blok 12, rum 110, Gustav Wieds Vej 10C, 8000 Århus C
Tlf: 8942 5025
E-post: pn@mb.au.dk

Øvrige lærere

Thomas Boesen, Jens Preben Morth og gæsteforelæsere

Undervisnings- og arbejdsform

2 F +1 TØ + 4 CØ pr. uge fordelt på 4. kvarter. Forelæsninger over lærebog og note-materiale (kompendium indeholdende originalartikler og øvelsesnoter), gruppearbejde/præsentationer til TØ samt computerøvelser.

Sprog:  

Materiale: engelsk
Forelæsninger: Dansk, såfremt der ikke er fremmedsprogede studerende, ellers engelsk.

Litteratur

Gale Rhodes, "CRYSTALLOGRAPHY MADE CRYSTAL CLEAR", Academic Press, 3. udgave, 2006, ISBN: 0-12-587073-6.

Udleverede noter (kompendium)

Kursushjemmeside

http://www.aula.au.dk/courses/CL3ffb/

Eksamensterminer

Eksamen: 4. kvarter
Reeksamen: Efter aftale med faglærer

Udbyder

Molekylærbiologisk Institut

Bedømmelse

• 7-dages skriftlig opgave
• ekstern censur
• 7-trinsskalaen