AU kursuskatalog arkiv

Enzymologi og makromolekylær kinetik (Q3+Q4) ( forår 2010 - 10 ECTS )

Rammer for udbud

• Uddannelsessprog: engelsk (eller dansk)
• Niveau: Bachelorkursus
• Semester/kvarter: 3. og 4. kvarter
• Timer per uge: 5
• Deltagerbegrænsning: Højst 24 deltagere
• Undervisningssted: Århus
• Hovedområde: Det Naturvidenskabelige Fakultet
• Udbud ID: 16361

Formål

Kurset har til formål at give deltagerne en dyberegående indsigt i enzymers kinetik og andre kinetiske fænomener forbundet med proteiners struktur, deriblandt anvendelser til bioteknologiske processer og sygdomsfremkaldende ændringer. Der vil også blive lagt vægt på grundlæggende databehandlingsmetoder.

Obligatorisk program

TØ, LØ samt artikelgennemgang og computerøvelser.

Indhold

Kinetiske måleteknikker. Protein engineering. Måling af enzymstabilitet. Kinetik forbundet med proteinstruktur: foldning og aggregering. Proteiner der virker på uopløselige substrater. Generelle principper for matematisk analyse af kinetiske data. Den molekylære baggrund for forskellige kinetiske uni- og bimolekylære reaktionstyper, udledning af de tilhørende ligninger og computersimulering. Bimolekylære reaktioner og deres faldgruber. Typisk enzymkinetik, mono- og bisubstrat reaktioner, inhibering, aktivering og kooperativitet. Enzymstrukturer. Multienzym systemer og metabolisk flux. Enzymer i organiske (ikkevandige) systemer.. Laboratorieøvelser til praktisk måling af enzym kinetik og anden makromolekylær kinetik. Anvendelse af industrielle enzymer i praksis.

Faglige forudsætninger

Videregående biokemi, Fysisk biokemi 1

Underviser

Ansvarshavende lærer

Navn: Daniel Otzen
Universitetsadresse: MBI, Forskerparken, bygning 2, 2. etage, rum 13

Telefonnummer: 89 42 50 46

E-mail: dao@inano.dk

Øvrige lærere

Sergey N. Fedosov, Zheng Guo, Gregers Rom Andersen

Undervisnings- og arbejdsform

3 F +2TØ/LØ pr. uge fordelt på 3. og 4. kvarter. Forelæsninger over lærebog og originallitteratur, studenterpræsentationer, samt computerøvelser, opgaveregning til TØ og praktiske laboratorieøvelser

Sprog:  

Materiale: Lærebog engelsk, noter m.m. på dansk
Undervisningssprog: Dansk, forelæsninger på engelsk (Xuebing Xu) vil forekomme

Litteratur

Alejandro G. Marangoni: Enzyme kinetics. A Modern Approach. Wiley Interscience 2003. ISBN 0-471-15985-9.

Athel Cornish-Bowden: Basic Mathematics for Biochemists. Oxford University Press, 1999. ISBN-13: 9780198502166.

Kapitler fra: Alan R. Fersht: Structure and Mechanism in Protein Science: A guide to enzyme catalysis and protein folding. W.H. Freman, New York 1999.

Cilin Ratledge and Bjørn Kristiansen (ed.), Basic Biotechnology (2nd. Ed.), Cambridge University Press, Cambridge 2001 (chapter 22).

Udleverede noter

Oritinallitteratur

Med hensyn til relevant matematisk baggrundsviden anbefales: Athel Cornish-Bowden: Basic Mathematics for Biochemists. Oxford University Press, 1999. ISBN-13: 9780198502166.

Kursushjemmeside

Der henvises til Aarhus Universitets e-learningssider: http://www.aula.au.dk

Eksamensterminer

Eksamen: Efter 4. kvarter
Reeksamen: Efter aftale

Udbyder

Molekylærbiologisk Institut

Særligt om dette kursus

Målgruppe: Bachelorkursus

Læringsmål

Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

• Udlede ligninger svarende til forskellige enzymatiske reaktionsmekanismer.
• Gøre rede for hvordan inhibitorer og aktivatorer kan påvirke disse mekanismer.
• Foreslå relevante kinetiske målemetoder til at studere en given reaktion og analysere de dermed forbundne data.
• Identificere de meste hensigtsmæssige måder at forbedre enzymatiske systemers produktionsevner.
• Gøre rede for hvordan kinetisk og termodynamisk stabilitet kan påvirke reaktionen.
• Forstå hvordan enzymer virker i organiske opløsninger.
• Forstå de særlige egenskaber ved immobiliserede enzymer og enzymsystemer.

Studieordning og bedømmelse

Fagpakke: Biokemi

• Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur

Tilvalgsfag: Molekylærbiologi

• Skriftlig, bedømt efter 7-skala med ekstern censur

• Skriftlig eksamen, 4 timer
• Bedømmelse efter 7-trinsskalaen
• Ekstern censur