AU kursuskatalog arkiv

Proteomanalyse (afholdes august 2010 - det er sidste gang) ( forår 2010 - 10 ECTS )

Rammer for udbud

• Uddannelsessprog: engelsk (eller dansk)
• Niveau: Kandidatkursus
• Semester/kvarter: Sommerkursus (uge 32-33, august). (30-40 timer/uge)
• Timer per uge: 2 uger i august; ugerne 33-34 (30-40 timer/uge)
• Deltagerbegrænsning: Kurset er begrænset til 12 deltagere. Minimum 6 tilmeldte kræves for kursets afholdelse.
• Undervisningssted: Århus
• Hovedområde: Det Naturvidenskabelige Fakultet
• Udbud ID: 23538

Formål

Formålet med kurset er at tilvejebringe en teoretisk og praktisk forståelse af de enkelte elementer som benyttes ved proteomanalyse.

Obligatorisk program

Hele kurset.

Indhold

Kurset består af en praktisk del hvor der foretages analyser i laboratoriet samt en teoretisk del bestående af kollokvier og foredrag. Ved den praktiske del af kurset benyttes blandt andet 2D-gelelektroforese og proteinoprensning samt en række forskellige applikationer af massespektrometri. De opnåede resultater og de anvendte teknikker vil løbende blive diskuteret.

Læringsmål

Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

• Redegøre for separation af proteiner ved hjælp af 2D gel elektroforese og beskrive faktorer som kan påvirke separationen.
• Redegøre for den grundlæggende opbygning af et moderne massespektrometer til protein/peptid analyse. Herunder
  • beskrive og sammenligne ioniseringsteknikker anvendt ved massespektrometrisk analyse af intakte proteiner og peptider.
  • beskrive principperne for massebestemmelse ved hjælp af en quadrupol og en time-of-flight analysator.
• Redegøre for tandem massespektrometri (MS/MS).
• Redegøre for protein identifikation ved hjælp af MS og MS/MS analyser.
• Redegør for MS/MS-baseret sekventering ved hjælp af "Chemical-assisted fragmentation". 
• Redegøre for brugen af databaser i forbindelse med proteinidentifikation ud fra massespektrometriske data.
• Redegør for de forskellige proteomanalytiske metoders styrker og svagheder.
• Analysere og fortolke de data som er genereret under den praktiske del af kurset og sammenligne disse data med information fra den teoretiske del af kurset og fra originallitteratur.

Faglige forudsætninger

3 års biologi-/molekylærbiologistudier.

Underviser

Ansvarshavende lærer
Navn: Jan J. Enghild
Institutadresse: Molekylærbiologisk Institut, Forskerparken, Bygning 4, rum 1.12, Gustav Wieds Vej 10C, 8000 Århus C
Telefonnummer: 8942 5062
E-mail: jje@mb.au.dk

Andre lærere
Henrik Karring og Kristian Wejse Sanggaard

Undervisnings- og arbejdsform

Praktiske øvelser og kollokvier med præsentationer, foredrag og gæsteforelæsere.

Undervisningssprog:  

Materiale: Engelsk
Undervisningssprog: Engelsk - såfremt der er udenlandske studerende på kurset ellers dansk

Litteratur

Lærebog: Principles of Proteomics
Forfatter: R. M. Twyman
Forlag: Bios Scientific Publishers Bios Scientific Publishers
ISBN: 1 85996 273 4

Det forventes at de studerende har læst kapitlerne: Kap. 1, 2, 3, 4, 5, 8, 9, 10 inden kursusstart. Kap. 6 og 7 læses kursorisk.

Det resterende undervisningsmateriale (bl.a. original litteratur) forefindes på http://www.aula.au.dk/ senest 2 uger før kursusstart.

Kursushjemmeside

 

Der henvises til Aarhus Universitets e-learningssider: http://www.aula.au.dk  og 

www.enghild-lab.dk

Eksamensterminer

Eksamen: En skriftlig rapport skal afleveres i september.
Reeksamen: Efter aftale med faglærer

Udbyder

Molekylærbiologisk Institut

Særligt om dette kursus

Kurset afholdes sidste gang sommeren 2010.

Tilmelding skal ske senest ved tilmeldingen 1.-15. november 2009.

Studieordning og bedømmelse

Tilvalgsfag: Molekylærbiologi

• Hj.opg., bedømt efter 7-skala med ekstern censur

• Aflevering af en skriftlig rapport
• Bedømt efter 7-trinsskala 
• Ekstern censur