[Forside] [Hovedområder] [Perioder] [Udannelser] [Alle kurser på en side]
Protein biofysik fokuserer på proteiner som biopolymerer med specifikke strukturelle og energetiske egenskaber. Det inddrager viden fra både kemi, biologi og fysik. I dette kursus vil vi beskrive, hvordan man undersøger proteiners fysisk-kemiske egenskaber (både som enkeltmolekyler og i kompleks med andre molekyltyper) og hvilken betydning disse har for forståelsen af deres biologiske funktioner.
TØ samt artikelgennemgang i løbet af kurset. Deltagelse i laboratorieøvelser og godkendelse af tilhørende rapporter.
De vekselvirkninger der bestemmer proteiners struktur og stabilitet gennemgås som optakt til de konformationelle ændringer, som proteiner undergår, når de folder og udfolder. Vi beskriver eksperimentelle teknikker og molekylære simuleringer til at følge disse processer. Herefter følger beskrivelse af foldningsegenskaber på flermolekyleniveau i form af kolloid stabilitet, protein aggregering og protein foldning/udfoldning i membraner og detergent miceller. Vi vil hertil gennemgå forskellige spredningsteknikker (baseret på lys, røntgen, og neutroner), som er specielt velegnede til at undersøge disse komplekser. Endelig vil vi gennemgå, hvordan masse-spektrometriske teknikker kan bruges til at (1) analysere post-translationelle modifikationer og (2) - i forbindelse med deuterium udveksling - identificere bindingssteder, strukturer, konformationelle ændringer og måle termodynamisk stabilitet.
Grundlæggende kendskab til biofysisk kemi.
Daniel Otzen (kursusansvarlig), Jan Skov Pedersen, Jan Johannes Enghild, Birgit Schiøtt, Alberto Imparato.
3 timers forelæsning og 2 timers øvelser/studenterpræsentationer pr. uge.
Dansk
Oplyses ved kursets start.
Vil være at finde på AULA.
Eksamen: 4. kvarter
Reeksamen: efter aftale med faglærer
iNano
Kurset er primært rettet mod studerende inden for Molekylærmedicin, Molekylærbiologi, Medicinalkemi og Nanoteknologi.
Når kurset er færdigt, forventes den studerende at kunne :
- gøre rede for de fysisk-kemiske forudsætninger for proteiners forskellige konformationer
- gøre rede for de intermolekylære vekselvirkninger der kontrollerer membran-bindende proteiner og protein aggregater
- beskrive forskellige eksperimentelle teknikker og deres fysiske principper til at undersøge disse konformationer og hvorledes den ønskede information uddrages fra målingerne
- beskrive forskellige simulerings teknikker og deres principper til at undersøge disse konformationer
- beskrive hvordan masse spektrometri kan anvendes som strukturel teknik
- redegøre for metoder til identifikation og karakterisering af post-translationelle modifikationer
- diskutere og formidle en videnskabelig artikel, der omhandler protein biofysik
4 timers skriftlig eksamen med alle hjælpemidler undtagen PC. Karakter efter 7-trinsskalaen og med intern censor.
