AU kursuskatalog arkiv

Kvantitativ Genetik og Avlsplanlægning (BS) ( forår 2011 - 15 ECTS )

Rammer for udbud

• Uddannelsessprog: dansk
• Niveau: Bachelorkursus (valgfag).
• Semester/kvarter: 10 ECTS i 1. kvarter af efterårssemesteret. 5 ECTS i 2. kvarter af efterårssemesteret. Kurset forventes afholdt første gang i efteråret 2010.
• Timer per uge: 4x2 forelæsninger og 4x2 lektioner teoretiske/computerøvelser i 6 uger. 2x2 forelæsninger og 2x2 lektioner teoretiske/computerøvelser i 6 uger. To besøg til avlsselskaber. Herudover 3 opgaver hver svarende til en halv uges arbejde
• Deltagerbegrænsning: Maks. 24 studerende.
• Undervisningssted: Århus
• Hovedområde: Det Jordbrugsvidenskabelige Fakultet
• Udbud ID: 11849

Formål

Kurset tager udgangspunkt i reelle problemstillinger fra moderne husdyravl. Gennem kursusforløbet erhverver du erfaring med metoder til avlsværdivurdering og avlsplanlægning. Du opnår også erfaring i at analysere og løse enkle men realistiske problemstillinger indenfor nedarvning af kvantitative egenskaber og konsekvenserne af selektion på kvantitative egenskaber ved hjælp af værktøjer fra kvantitativ genetik. Du bliver i stand til at foretage avlsværdivurdering og til at opstille avlsplaner i enkle situationer. De nyeste, aktuelle metoder inddrages i løsningen af problemstillingerne, herunder anvendelsen af molekylære data.

Læringsmål

Efter kurset kan du:

• Sammenfatte hovedprincipperne i modeller for kvantitativ genetisk variation, herunder den infinitesimale model og finite locus -modellen.
• Sammenfatte hvordan delte miljøeffekter og delte gener bidrager til ligheder blandt slægtninge.
• Forklare konsekvenserne af selektion på kvantitative egenskaber, herunder selektionsrespons, ændringer af varians, korreleret respons, indavl og molekylære konsekvenser af selektion.
• Sammenfatte styrker og svagheder ved forskellige metoder til avlsværdivurdering
• Anvende avlsværdivurdering på et forberedt eksempel.
• Sammenligne realistiske avlsplaner for vigtige husdyrarter.
• Sammenfatte virkninger af ændringer i avlsplaner, herunder brugen af reproduktionsteknologi, selektionsstrategier, parringsstrategier, økonomiske værdier og populationsstørrelse.
• Forklare ligheder og forskelle på avlsplaner på populations- og besætningsniveau.
• Sammenligne metoder til inkorporation af DNA-markørinformation og information om enkeltgener med effekter på kvantitative egenskaber i avlsværdivurdering og avlsbeslutninger.
• Sammenfatte konsekvenser af brugen af DNA-information i avlsarbejdet og sammenligne disse med effekten af konventionelt arvlsarbejde.

Indhold

På kurset arbejder du med tre discipliner, som indgår med lige vægt.
Kvantitativ Genetik
Grundlæggende modellering af nedarvningen af kvantitative egenskaber, dvs. kontinuerte egenskaber, som  er under indflydelse af både gener og omgivelserne. Du anvender både modeller med enkelte gener og modeller med uendeligt mange gener. Herunder behandler du genetisk variation, indavl, krydsningsfrodighed, selektion, selektionsrespons såvel som arten af den molekylære variation, som underligger den kvantitative genetiske variation. Avlsværdivurdering
Avlsværdivurderingen sigter på at vurdere den genetiske værdi af hvert dyr med henblik på rangordning og udvælgelse af de dyr, som har de bedste genetiske anlæg. Du lærer at anvende statistiske modeller, som antager, at dyrenes egenskaber er normalfordelte, til at adskille effekter af genetik og miljø; herunder modeller, som inkluderer molekylær information og information fra slægtninge.
Avlsplanlægning
Avlsplaner designes med henblik på at opnå avlsfremgang under hensyntagen til indavl. Avlsplanerne opstilles under hensyn til den pågældende arts biologiske forhold, f.eks. reproduktionsevnen. Emner, som vi arbejder med, omfatter brugen af molekylær information, opstilling af avlsmål, reproduktionsteknologier, udvælgelsesstrategier og parringsstrategier. Du lærer at sammenligne forskellige avlsplaner ved hjælp af simulationsværktøjer. Projekter

I løbet af kurset udarbejder du desuden et projekt i hvert af de tre delområder. Omfanget af hvert projekt svarer til ca. 1 ECTS.

Faglige forudsætninger

Forkundskaber svarende til "Genetik og Evolutionslære", "Biostatistik" og "Almen Molekylærbiologi" eller tilsvarende. 

Underviser

Jan Lassen (kursusansvarlig), Daniel Sorensen, Anders Christian Sørensen.

Undervisnings- og arbejdsform

Forelæsninger, teoretiske øvelser og opgaver, computerøvelser, projekter, besøg hos avlsselskaber.

Dansk og engelsk, undervisningsmateriale på engelsk.

Litteratur

Falconer & Mackay, Introduction to Quantitative Genetics, 4. udgave Mrode, Linear Models for the Prediction of Animal Breeding Values

Undervisningsnoter, originallitteratur

Studieordning og bedømmelse

Bacheloruddannelsen i jordbrug, fødevarer og miljø, fødevarekvalitet

• Mundtlig, bedømt efter 7-skala med intern censur

Bacheloruddannelsen i jordbrug, fødevarer og miljø, husdyrbiologi og produktion

• Mundtlig, bedømt efter 7-skala med intern censur

Bacheloruddannelsen i jordbrug, fødevarer og miljø, jordbrug og miljø

• Mundtlig, bedømt efter 7-skala med intern censur

Bacheloruddannelsen i jordbrug, fødevarer og miljø, planteproduktion

• Mundtlig, bedømt efter 7-skala med intern censur

30 minutters mundtlig eksamen uden forberedselse og hjælpemidler bedømt efter 7-skalaen med intern censur. Eksamen er en diskussion med udgangspunkt i projektrapporter. De tre projektrapporter skal være godkendt, inden indstilling til eksamen kan finde sted.