[Forside] [Hovedområder] [Perioder] [Udannelser] [Alle kurser på en side]
Deltagerne vil gennem projektarbejde opnå et indgående kendskab til udvalgte emner inden for genomanalyse. Emnerne sigter på anvendelser inden for medicinsk forskning og medicinindustrien. Dette indbefatter kendskab til hvilke typer genomdata der findes, hvorledes de forskellige typer data kan analyseres og hvilke anvendelsesmuligheder der findes. Kursets arbejdsform vil træne deltagernes evne til at planlægge og udføre dataanalyse samt formidle og kommunikere faglige problemstillinger og resultater.
Aktiv deltagelse i øvelser og godkendelse af to obligatoriske opgaver.
Kurset er organiseret som 1-3 projekter, der hver især fokuserer på anvendt bioinformatik og det teoretiske fundament. Projekterne bliver løbende udviklet og fornyet, men kunne f.eks. omhandle:
Projekterne omfatter typisk formatering og filtrering af data (python), analyse og rapportskrivning. Hver uge læses baggrundsartikler, og der lægges vægt på 'Integrative Analysis' - analyser hvor der gøres brug af flere datatyper eller hvor data kobles til information fra databaser vedr. funktion, pathways eller anden genomisk annotering.
Kurserne Introduktion til bioinformatik og Anvendt Programmering
Palle Villesen Fredsted og Carsten Wiuf
Forelæsninger (1t+1t/uge) Øvelser (4t/uge) (1 t artikeldiskussion + 3 t computerøvelser)
Dansk
Original artikler. Følgende grundbog kan benyttes som reference: Marketa Zvelebil og Jeremy O. Baum: Understanding bioinformatics, Garland, Science Taylor & Francis Group, 2008
http://www.birc.au.dk/Studies/MGA
Eksamen: 4. kvarter
Placering: Uge 25
Center for Bioinformatik (BiRC)
Via selvbetjeningen
Deltagerne skal ved afslutningen af kurset kunne:
Mundtlig eksamen uden forberedelse (20 min), 7-trin skala, intern censur
